El Catecismo cristiano es la más importante de las obras escritas por Carranza, editada en 1558 y causa de su procesamiento.
El libro estaba escrito con notable intención antiherética. No obstante cuando Carranza llega a Valladolid en Agosto de ese mismo año, conoce que el Inquisidor General se ocupa de examinar su catecismo. El propio Carranza apunta en una carta, las razones que cree mueven a tal persecución: La prohibición de obras en lengua vulgar y la animosidad contra él del Inquisidor General.
Carranza estructura el Catecismo de la siguiente manera:
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Símbolos o artículos de la fé: lo que hemos de creer.
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Los diez mandamientos: lo que hemos de obrar.
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Los siete sacramentos, instrumentos y testimonios de lo que Dios obra en nosotros por la pasión de su Hijo.
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La oración, el ayuno y la limosna como las obras más principales y generales, frutos de las virtudes cristianas y naturales.