La segunda fase – 1485-1487
En la segunda parte, el ejército católico era mejor preparado y luego consiguió más éxito.
En 1485, El Zagal consigue expulsar a Boabdil de Granada y los cristianos consiguen tomar Ronda en menos de 15 días. Un poco más tarde, consiguen tomar Marbella y su puerto que se convirtió en la base de la flota naval. En el mismo año, murió Muley Hacen y le succedió su hermano El Zagal.
En septiembre de 1486, Boabdil regresó a Granada y, con el apoyo de los Reyes Católicos que le dabían armas y comidas, volvió a elevarse. Pero un leventamiento del barrio de Albaicín de Granada hizo Boabdil cambiar su opinión y se unió de nuevo a El Zagal contra las cristianos.
En 1487, Boabdil firmó un acuerdo con los cristianos para dejarlos la soberanía del reino mientras que él se asignaba el señoria y ambas partes decidieron unirse contra El Zagal.
Pero el acuerdo no existió mucho tiempo.
En 1487, los cristianos toman Loja y Boabdil volvió a ser prisionero. Este ofensiva produce un movimiento de musulmanes hacia Granada.
Un poca más tarde, tomaron Málaga.