Juana de Austria
Otra mujer presente en la juventud del príncipe Felipe II es su otra hermana, Juana de Austria. Juana de Austria, archiduquesa de Austria e infanta de España, nació el 24 de junio 1535, en Madrid en El Monasterio de El Escorial. Ella fue también hija de Carlos V y de Isabel de Portugal. Juana de Austria era la hermana menor de Felipe II. A pesar de que ella era más joven, a veces ayudaba a su hermano mayor, Felipe II. Por ejemplo, cuando Felipe II se va a Inglaterra para casarse con su segunda esposa, María I de Inglaterra, Juana se hizo carga de la regencia de España.
A la edad de 17 años, se casó con su primo, el príncipe de Portugal, Juan Manuel de Portugal, que tenía solamente 15 años. Este matrimonio fue importante en de la historia de los dos países ibéricos dentro de la política de España de acercamiento a Portugal para la subida al trono portugués de Felipe II o también llamado Felipe I de Portugal. Así Portugal fue dirigido por España en una unión dinástica. Su esposo Juan de Portugal murió muy joven de una tuberculosis. Tendrá un hijo con él, que nunca conoció a su padre. Cuando su marido murió, ella reclamó la regencia en nombre de su hijo. Desgraciadamente su suegra y Caterina de España no querían y Juana se va a Castilla. Ella gobernó el reino de España durante las ausencias de Felipe II. Juana de Austria también jugaba un papel importante en la historia dentro de la Compañía de Jesús, siendo la única mujer que ingresara en dicha orden religiosa masculina. Juana de Austria fue la única mujer que vivió y que murió como un jesuita. Murió el 7 de septiembre en 1573.