Mientras que los progresistas, denominados septembristas, querían volver a implantar la constitución de 1821, los moderados, cartistas, querían imponer la constitución de 1826, po lo que la reina María II, que era favorable a los cartistas, entregó el poder a Cabral, nombrándolo ministro de justicia, y cabral gobernó el país de forma dictatorial, provocando el descontento de la población, y se desarrolló una guerra civil, y la reina tuvo que destituirlo y llamar al gobierno al partido progresista.En 1853 murió María II dando a luz a su undécimo hijo con 34 años, y con el reinado de María II terminó en Portugal la Casa de Braganza, la reina se había casado con Fernando II de la Casa Sajonia-Coburgo-Gotha, y através de este matrimonio, la casa alemana pasó a reinar en Portugal.El sucesor de María II sería su hijo Pedro V, siendo pequeño, subió su padre Fernando II que tuvo que asumir la regencia, y en 1855 llegó a la mayoría de edad y tomó las riendas del reino, por lo que se inició un largo período de estabilidad, en el que Portugal era un modelo de monarquía constitucional, en la que se respetaban los derechos individuales .
Pese a la paz social, la industrialización y la modernización de la agricultura, así como la alfabetización de la población, fueron más lentos en Portugal que en cualquier otro país de la Europa occidental, una crisis política entre 1868 y 1872, coincidiendo con el sexenio democrático español, en 1890 se produjo crisis colonial en África, y en 1908 el rey Carlos I y su príncipe heredero fueron asesinados a tiros en la Praça do Comércio de Lisboa, el nuevo rey, Manuel II culpó de los sucesos a João Franco primer ministro de su padre que había gobernado de forma dictatorial durante los últimos años. João Franco fue destituido pero el nuevo rey no pudo mejorar la imagen de la monarquía ni frenar el empuje del movimiento republicano, y en 1910 se proclamó la república, marchando el monarca al exilio en Reino Unido, mas tarde le sucederá la I República , la revolución de los claveles ( una de las revoluciones mas importantes ) y por último la III República .