Su abuela paterna

            — Leonor de Avis y Trastámara (1434-1467)

Infanta de Portugal y emperatriz consorte del Sacro Imperio Romano Germánico. Fue hija de Eduardo I ( rey de Portugal, de la Dinastía de Avís) y de la infanta Leonor de Aragón y Alburquerque. Era hermana menor de Alfonso V el Africano. Se casó con el emperador germánico Federico III de Habsburgo, de este matrimonio nacieron cinco hijos (Maximiliano, sucesor de su padre con el nombre de Maximiliano I).

Su abuela materna

             — Isabel de Borbón, duquesa de Borgoña (1436 – 1465)

Era hija del duque de Borbón y de Inés de Borgoña, y esposa de Carlos el Temerario.

El 30 de octubre de 1454 se casó con Carlos el Temerario en Lille, hijo del duque Felipe el Bueno y su tercera esposa, la infanta Isabel de Portugal. Esta unión no era deseada por Carlos que quería esposar a Margarita de York. Su padre le recuerdó entonces los términos del tratado de Arras, que lo obligaron a desposar una princesa de sangre francesa. De este matrimonio nació su única hija legítima: María de Borgoña, quien se casaría con Maximiliano de Habsburgo, futuro emperador romano.